“Nhìn chỗ này, sẽ không có ai biết đâu.” “Chúng ta sẽ biết.” – Mbizi và Jack Valentine, Lord of War.

Với mong muốn nhìn thấy Ui cười một lần nữa, Iroha đã ký một hợp đồng với Kyubey, và kỳ diệu đó đã chữa lành Ui, nhưng đổi lại, Iroha đã trở nên hiếm hoi hơn khi thời gian của cô gắn liền với việc chiến đấu với phù thủy. Sau khi biết điều này, Ui, Nemu và Tōka bắt đầu điều tra và kết luận rằng tất cả các Cô Gái Phép Thuật đều trở thành phù thủy. Biết điều này, ba người này lên kế hoạch cứu Iroha và làm hỏng hệ thống của Kyubey bằng cách đưa ra các điều ước để tiêu diệt sức mạnh của Kyubey, từ đó giúp làm sạch Ngọc Hồn và biến nó thành ma thuật, và chuyển đổi năng lượng này để liên tục làm sạch Ngọc Hồn trong một khu vực và cứu Iroha khỏi số phận đen tối như vậy. Tuy nhiên, chỉ sau một lúc làm điều ước này, Ui đã tồn tại quá nhiều tạp chất mà cô không thể chịu đựng và bắt đầu biến thành một phù thủy. Sự xuất hiện của Alina cho phép Tōka và Nemu chuyển tâm ý của Ui vào cơ thể trống rỗng của Kyubey và thiết kế một kế hoạch mới để cứu tất cả các Cô Gái Phép Thuật. Hiện tại, Nemu và Tōka giam Iroha trong một chiều không gian nhỏ để tiếp tục kế hoạch của họ, khiến cảnh duy nhất của tất cả các Cô Gái Phép Thuật lân cận bắt đầu hiện hình Doppel. Momoko và Mifuyu đã truyền năng lượng tiêu cực lên chính họ để cứu những Cô Gái Phép Thuật khác. Dù thành công, cả hai đã qua đời vì nỗ lực. Trong chiều không gian nhỏ, Iroha gặp Ui lần nữa, người hứa rằng miễn là Iroha biết hạnh phúc, cô ấy cũng sẽ nhớ cô. Ui yêu cầu Iroha ngăn cản Tōka và Nemu khỏi thực hiện kế hoạch của họ và yêu cầu cô cứu Kuroe. Iroha cố gắng nói chuyện Kuroe trở lại. Kuroe tiết lộ rằng cô ấy hối tiếc nhất khi để lại một Cô Gái Phép Thuật khác trong quá khứ, và cô ấy không xứng đáng với lòng tốt của Iroha. Tuyệt vọng tràn ngập cô, và cô biến thành một phù thủy, buộc Iroha phải giết cô. Trong quá trình đó, Iroha bắt đầu nghi ngờ chính bản thân mình, nhưng Yachiyo, Tsuruno, Felicia và Sana đã đến bên cô, nhắc nhở cô rằng miễn là có họ, mọi người có thể chia sẻ gánh nặng của nhau. Tinh thần của Iroha được làm mới và cả năm người đuổi kịp Tōka và Nemu, những kẻ đã lên kế hoạch để hợp nhất Embryo Eve với Walpurgisnacht. Mặc dù Tōka và Nemu bị thuyết phục, Alina xuất hiện và từ chối từ bỏ, có ý định tạo nên một thực thể để trừng phạt thế giới vì đã nhìn thời gian mà Cô Gái Phép Thuật chịu đựng. Tōka và Nemu cuối cùng đã hy sinh bản thân để cản trở Alina, và cuối cùng, Ui xuất hiện với Iroha và nhấn mạnh lại mong muốn của cô ấy để Iroha tìm hạnh phúc với những người đang sống. Iroha có thể hiện sức mạnh của Ui để thu thập lòng tuyệt vọng và cùng với Yachiyo, người nhận ra cô mang trong mình hy vọng của những người xung quanh, hai người cùng giết chết Alina, kết thúc mối đe dọa mà Embryo Eve gây ra. Madoka theo dõi, nhận ra rằng mặc dù đây là một câu chuyện mà không ai biết, cô ấy đã ghi chép lại nó để truyền đời sau. Sau hai năm hành trình, Magia Record cuối cùng cũng kết thúc, đánh dấu sự trở lại hoan nghênh của vũ trụ Puella Magi Madoka Magica và trình bày một chiều không gian khác của thế giới mà Puella Magi Madoka Magica từng bắt đầu khám phá trong thời kỳ hoạt hình ban đầu của nó.

Trong suốt Magia Record, ý tưởng về sự hiệp nhất được nhấn mạnh lần nữa: Magia Record là một câu chuyện về sức khỏe tâm thần, và cụ thể hơn, là việc quan trọng của việc tâm sự với người khác và không cho nỗi nghi ngờ của chính mình thống trị. Trên thực tế, trầm cảm là một trong những thách thức về sức khỏe tâm thần phổ biến mà cá nhân phải đối mặt. Tổ chức Y tế Thế giới ước tính rằng khoảng 3,8% dân số bị ảnh hưởng, và con người báo cáo một loạt vấn đề, từ lòng tự trọng kém và mệt mỏi liên tục, đến mô hình giấc ngủ kém và thậm chí ý nghĩ về tự tử. Dù có sự nỗ lực nghiên cứu và các chiến dịch tăng cường nhận thức, trầm cảm vẫn khó xử lí vì những người bị ảnh hưởng có thể không nhận ra rằng mình đang gặp vấn đề này; họ có thể coi đó là một vấn đề ngắn hạn và cố gắng tồn tại. Tuy nhiên, điều này tạo ra một vòng lặp tích cực chỉ làm tồi tệ hơn. Bên ngoài việc điều trị lâm sàng và thuốc, được phát hiện rằng hỗ trợ xã hội là một biện pháp chống lại mạnh mẽ, và đây chính là hỗ trợ xã hội mà Magia Record đang miêu tả như một phần thiết yếu. Iroha đã cố gắng chịu đựng gánh nặng cho sự phát triển tốt đẹp của em gái mình và bắt đầu trả giá cho những lựa chọn của mình. Kuroe đã tẩy chay một Cô gái phép thuật đang cần sự giúp đỡ và từ đó không thể không tự hỏi liệu mọi thứ có thể trở nên khác biệt không. Cả hai đều là những Cô Gái Phép Thuật yếu hơn bị ép vào góc cạnh, nhưng điểm khác biệt ở đây là sau khi Iroha đến Kamihama, cô trở nên gần gũi với Yachiyo, Tsuruno, Filicia và Sana. Trong suốt Magia Record, cho thấy “những cô gái yếu” phép thuật hướng đến Cánh Buồm của Magius, hi vọng tìm được một phương pháp giải quyết nhanh chóng cho các vấn đề của họ, nhưng cuối cùng, Cánh Buồm của Magius tan biến. Có vẻ như “cô gái yếu” không có nghĩa là yếu về khả năng, mà tương đối yếu trong việc chịu đựng những cảm giác tiêu cực, vô dụng, vô giá trị và cô đơn. Khi không được thể hiện, những cảm giác này sẽ càng tồi tệ hơn theo thời gian. Tuy nhiên, khi có người khác ở bên cạnh, bạn có thể nói với họ về những vấn đề của mình, và dù nó có thể là khó chịu như thế nào khi phải nghe ý kiến khác, điều này buộc tâm trí bạn mở cửa. Bằng cách này, việc có sự hỗ trợ giúp Cô Gái Phép Thuật nói ra những lo lắng, sự nghi ngờ và điểm yếu của bản thân, thích nghi với bóng tối bên trong của mình. Như Iroha đã nhận ra, những cảm giác tiêu cực của bản thân không phải là một phần của mình để sợ, mà đó là một phần tự nhiên của tồn tại, và dù những cảm giác này có thể trở nên không thể vượt qua tại một thời điểm nào đó, thì có người khác ở bên mình giúp đặt mọi thứ vào một góc nhìn, cho mình sức mạnh để chấp nhận nhược điểm của chính mình và ôm những điểm mạnh của mình. Magia Record không thể chối cãi rằng hành trình hồi phục đòi hỏi mở lòng, tin tưởng và sự hỗ trợ từ người khác. Con người sẽ mạnh mẽ hơn khi cùng nhau đối mặt với những thách thức ngày càng mạnh mẽ và mở lòng với nhau. Nhưng ngoài ra, Magia Record cũng cho thấy tác động nguy hiểm của kiến thức không đầy đủ. Qua Tōka và Nemu đặc biệt, Magia Record cho thấy hậu quả của việc áp dụng kiến thức lý thuyết mà không xem xét các kết quả tiềm năng của một quyết định trong thực tế. Hình ảnh này đặc biệt sống động; Nemu được mặc áo hưởng dụng với chiếc mũ hình hóa sĩ, và Tōka mặc trang phục thời Victoria. Cặp đôi này được trình bày như những người tài năng và ưu tú, luôn muốn làm điều tốt và cứu Iroha, người mà họ cho rằng đã hi sinh bản thân để cứu Tōka, Nemu và Ui. Muốn để lại di sản của riêng mình trên thế giới, ba người này đã nghĩ ra hệ thống của mình dựa trên những ý tưởng tốt đẹp, và nghiên cứu về cách Cô Gái Phép Thuật hoạt động để tạo ra một hệ thống có thể đánh bại và vượt qua những gì Kyubey đã xây dựng. Với kiến thức lý thuyết của mình, Tōka, Nemu và Ui đã tưởng tượng ra rằng hệ thống của họ sẽ là cách để né tránh số phận đang chờ đợi tất cả Cô Gái Phép Thuật. Tuy nhiên, gần như ngay sau khi đưa kế hoạch của họ vào hành động, Ui đã bị hi sinh, hậu quả của việc ba người không nhận ra một sự thật đơn giản: trong giảng đường và sách giáo trình, các hệ thống mô phỏng được định nghĩa với các thông số kiểm soát nghiêm ngặt để minh họa một khái niệm. Trong thực tế, các hệ thống không tồn tại trong một không gian riêng biệt và tương tác với nhiều hệ thống khác để tạo thành các mạng lưới tương tác. Sự thay đổi từ bất kỳ thành phần nào có thể gây ra hậu quả không mong đợi cho một phần khác của hệ thống. Điều này chính là những gì đã xảy ra: dù thông minh đến đâu, Tōka, Nemu và Ui đã không thể tính đến việc một người không thể hấp thụ lượng lớn năng lượng tiêu cực mà không ảnh hưởng đến cơ thể họ. Hệ thống của chính Incubator không phụ thuộc vào cơ thể người và do đó không bị giới hạn này, đó là cách mà các hệ thống hoạt động cho họ mà không gây tác động có hại, nhưng đối với Ui, hậu quả rất nghiêm trọng. Không muốn thừa nhận thất bại, Tōka và Nemu đã kết thúc bằng việc gắn chặt rơi vào sự dối trá và tin rằng từ khi Ui đã bị mất, họ cần tiến lên để đảm bảo việc hi sinh của Ui đáng giá. Quyết định này đánh dấu cặp đôi như những người ngốc, nằm trong sự tương phản sắc nét với trang phục trí thức tinh tế của họ. Tại đây, Magia Record ngụ ý rằng lý thuyết mà không có giá trị giới hạn và hơn nữa, giá trị của chủ đề học thuật cụ thể sẽ không biết rõ cho tới khi có hoạt động trong một môi trường thực tế. Cố gắng để đồng nhất với các sự kiện Madoka Magica vào các mô hình triết học hoặc tâm lý có thể không có ý nghĩa đặc biệt, bởi vì các mô hình hiện có đặt ra giả định mà Madoka Magica không nhất thiết tuân theo cho mục đích của một câu chuyện; như cách kế hoạch của Tōka và Nemu sụp đổ xung quanh họ, đút lý thuyết học vào Madoka Magica có nghĩa là bỏ qua việc tập trung của loạt phim vào sự quan trọng của mạng lưới hỗ trợ xã hội và khám phá vấn đề cùng nhau.

Trong Magia Record, câu chuyện được lặp đi lặp lại: nó là một câu chuyện về sức khỏe tâm thần và cụ thể hơn, về cách tâm sự với người khác quan trọng và không cho sự nghi ngờ bên trong tự ngự trị. Trong thực tế, trầm cảm là một trong những thách thức sức khỏe tâm thần phổ biến nhất mà con người phải đối mặt. Tổ chức Y tế Thế giới ước tính rằng khoảng 3,8% dân số bị ảnh hưởng, và con người báo cáo một loạt vấn đề, từ lòng tự trọng kém và mệt mỏi liên tục, đến mô hình giấc ngủ kém và thậm chí ý nghĩ về tự tử. Dù có sự nỗ lực nghiên cứu và các chiến dịch tăng cường nhận thức, trầm cảm vẫn khó xử lí vì những người bị ảnh hưởng có thể không nhận ra rằng mình đang gặp vấn đề này; họ có thể coi đó là một vấn đề ngắn hạn và cố gắng tồn tại. Tuy nhiên, điều này tạo ra một vòng lặp tích cực chỉ làm tồi tệ hơn. Bên ngoài việc điều trị lâm sàng và thuốc, được phát hiện rằng hỗ trợ xã hội là một biện pháp chống lại mạnh mẽ, và đây chính là hỗ trợ xã hội mà Magia Record đang miêu tả như một phần thiết yếu. Iroha đã cố gắng chịu đựng gánh nặng cho sự phát triển tốt đẹp của em gái mình và bắt đầu trả giá cho những lựa chọn của mình. Kuroe đã tẩy chay một Cô gái phép thuật đang cần sự giúp đỡ và từ đó không thể không tự hỏi liệu mọi thứ có thể trở nên khác biệt không. Cả hai đều là những Cô Gái Phép Thuật yếu hơn bị ép vào góc cạnh, nhưng điểm khác biệt ở đây là sau khi Iroha đến Kamihama, cô trở nên gần gũi với Yachiyo, Tsuruno, Filicia và Sana. Trong suốt Magia Record, cho thấy “những cô gái yếu” phép thuật hướng đến Cánh Buồm của Magius, hi vọng tìm được một phương pháp giải quyết nhanh chóng cho các vấn đề của họ, nhưng cuối cùng, Cánh Buồm của Magius tan biến. Có vẻ như “cô gái yếu” không có nghĩa là yếu về khả năng, mà tương đối yếu trong việc chịu đựng những cảm giác tiêu cực, vô dụng, vô giá trị và cô đơn. Khi không được thể hiện, những cảm giác này sẽ càng tồi tệ hơn theo thời gian. Tuy nhiên, khi có người khác ở bên cạnh, bạn có thể nói với họ về những lo lắng của mình, và dù nó có thể là khó chịu như thế nào khi phải nghe ý kiến khác, điều này buộc tâm trí bạn mở cửa. Bằng cách này, việc có sự hỗ trợ giúp Cô Gái Phép Thuật nói ra những lo lắng, sự nghi ngờ và điểm yếu của bản thân, thích nghi với bóng tối bên trong của mình. Như Iroha đã nhận ra, những cảm giác tiêu cực của bản thân không phải là một phần của mình để sợ, mà đó là một phần tự nhiên của tồn tại, và dù những cảm giác này có thể trở nên không thể vượt qua tại một thời điểm nào đó, thì có người khác ở bên mình giúp đặt mọi thứ vào một góc nhìn, cho mình sức mạnh để chấp nhận nhược điểm của chính mình và ôm những điểm mạnh của mình. Magia Record không thể chối cãi rằng hành trình hồi phục đòi hỏi mở lòng, tin tưởng và sự hỗ trợ từ người khác.